MI Muhammadiyah 28 Surabaya memiliki tiga lantai gedung. Di setiap lantai memiliki sarana maupun fasilitas untuk anak didik.
Kamar mandi untuk siswa-siswi, salah satunya. Meski, di tiap lantai pasti ada, Sekolah menyediakan dua kamar mandi untuk siswa dan siswi.
Untuk memberikan kenyamanan para anak didik selama di Sekolah, kamar mandi dan tempat berwudhu selalu bersih.
Sekolah dipastikan memperhatikan kebersihan kamar mandi dengan cara sebelum bel bunyi tanda masuk sudah bersih.
Setelah jam istirahat pertama dan kedua, bathroom juga bersih. Usai para anak didik pulang sekolah, kamar mandi juga dirawat kebersihan.